01 - Backofen auf 400°F (200°C) vorheizen. Ein Backblech mit Backpapier auslegen.
02 - Paprika, Zucchini, Kirschtomaten und rote Zwiebel mit Olivenöl, Salz und schwarzem Pfeffer vermengen. Auf das Backblech geben und 18–20 Minuten rösten, dabei einmal umrühren, bis das Gemüse zart und leicht karamellisiert ist. Aus dem Ofen nehmen und kurz abkühlen lassen.
03 - Ofentemperatur auf 350°F (175°C) reduzieren. Ein 12er-Muffinblech einfetten oder mit Silikonförmchen auslegen.
04 - Eier und Milch in einer großen Schüssel kräftig verquirlen. Das geröstete Gemüse, Ziegenkäse, Parmesan, Basilikum, Thymian und, falls gewünscht, Chiliflocken hinzufügen und umrühren.
05 - Die Mischung gleichmäßig in die Muffinförmchen geben, jeweils etwa zu 3/4 füllen.
06 - Muffins 18–22 Minuten backen, bis sie fest sind und eine leichte goldene Farbe haben.
07 - Frittata-Muffins 5 Minuten im Blech abkühlen lassen, dann herauslösen. Warm oder bei Zimmertemperatur servieren.